Open Science Radio

Ja, es ist schon wieder etwas her und es hat sich mal wieder ein ganzer Sack von News angesammelt. Erstaunlicherweise geht’s in einer Reihe von Themen mal wieder etwas technischer zur Sache, denn wir haben nicht nur ein paar Tools im Gepäck, sondern schweifen auch immer wieder auf technisch getriebene Themen ab – nicht selten mit Bezug zu Konrad’s Haus- und Hofthema, der Bioinformatik. Viel Spaß!

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Teilnehmer

• Matthias Fromm
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Shownotes: OSR033 Bioinformatischer Einschlag

Begrüßung 00:00:00

OKCast; — Chaosradio Bioinformatik; — Bastian Greshake; — Bastian bei Explorism;.

Hausmeisterei 00:09:27

Tech-Dirt Artikel zur Rolle von Open Access in der Ebolabekämpfung; — Hörerfrage zur Promotion in der Bioinformatik; — Katrin Leinweber von KonScience hat mal PeerJs Paper Now getestet; — Katrin's Paper ist mittlerweile auf PeerJ erschienen;.

News - Activism 00:12:36

Wikipedia Science Conference; — Hackathon auf der Science Conference; — Wikimedia adopts open licensing policy for foundation-funded research; — Kürzlich war ein Open Science AG Public Call; — Blogpost dazu; — Nächster Call End Mai oder Anfang Juni; — Deutschsprachiger Open Science Twitter-Account; — Twitter deinen offenen Alltag; — Treffen auf dem Chaos Communication Camp; — Pavel Richter ist neuer CEO von Open Knowledge; — Pavel Richter;.

News - Open Access & Lizenzen 00:21:25

Hinweis von Bernd Rupp auf den OA Newsletter der Helmholzgemeinschaft; — Blogpost bezüglich der Nachhaltigkeit des PeerJ-Geschäftsmodels; — Self-host a scientific journal with eLife Lens; — eLife; — eLife Lens Reader; — eLife Lens Reader auf Github; (Studie vom der Max-Planck Digital Library - “Disrupting the subscription journals’ business model for the necessary large-scale transformation to open access” (PDF) [OPEN];)  — FAZ Artikel dazu; — Konrad's erfolgreichster Tweet; — open-access.net in neum Gewand und mit neuen Inhalten; — F1000Research to publish the ISCB Community Journal; — International Society of Computational Biology (ISCB); — PLoS Computational Biology; (Konrad war auf dem CeBiTec Symposium - Rolf Apweil hat über die Geschichte der Sequenzierdatenbanken erzählt: Waren von Beginn (1982) open!;)  — EMBL EBI; — Rolf Apweiler;.

News - Tools 00:48:20

Hörerhinweis von Frank Römer; — Common Workflow Language; — Docker in Life Sciences; — Docker; — eLife Recognizing the importance of new tools and resources for research; — UbuntuScience; — Björn Brembs über die wissenschaftliche Infrastruktur; — Software Carpentry; — Blogpost "PhD Starter Kit: Preparing for Life in Academia Available" von Achintya Rao; — Open Trials versucht Transparenz auch für klinische Studien zu fördern; — OpenTrials; — ContentMine;.

News - Open Data 01:22:12

WHO calls for all clinical trial results to be published; — Ben Goldacre: "How to Get All Trials Reported: Audit, Better Data, and Individual Accountability" [OPEN]; — DataCite übernimmt die Fortentwicklung von re3data.org;.

News - Peer Review & Metrics 01:26:35

Pedro Beltrao: Scientific Reports partners with Research Square to unbundle peer-review; — Dozens Of Scientific Papers Withdrawn After Peer-Review Fraud Uncovered; (Nature Biotechnology - Rebooting review [OPEN];)  — iPython Notebook; — Jupyter; — Briefings in Bioinformatics: "BIB's first impact factor is 24.37" [OPEN]; — Blogpost dazu; — MEGA3; — Elizabeth Marincola kündigt Änderungen des Peer Review Verfahrens bei PLOS an; — Das gesamte Interview wird im kommenden R.Science Podcast erscheinen;.

Misc 01:38:33

Folien und Audio von Katrin Leinwebers Vortrag zum Thema Wissenschaftkommunikation via PodCasts; — Science Biggest Fail; — Vox.com Artikel: "This is why you shouldn’t believe that exciting new medical study"; — John Ioannidis Interview dazu bei Vox.com; — Why Most Published Research Findings Are False; — Videos der Science 2.0 Conference 2015 sind verfügbar; — Auch von der Postdigital Scholar Conference an der Leuphana Lüneburg sind mittlerweile alle Videomitschnitte erschienen; — XKCD: The Economic Argument; — Copyright from the lens of a lawyer (and poet) [OPEN]; — Antwort von Mike Taylor; — Antwort von Björn Brembs; — EuroScientist Special zu Reproducibility and Replicability; — Sascha Förster startete einen eigenen Podcast; — Es gibt erste Details zur OpenCon 2015; — NASA's Data Portal; — NASA's PSI Data Repository; — re:publica15 Talk von Christine Corbett Moran “Simulating the Universe: Supercomputers in Astrophysics”;.

Epilog 02:05:00